Hyperspectral imaging for presumptive identification of bacterial colonies on solid chromogenic culture mediaauthor:Mathilde Guillemota,Rony Midahuena, Delphine Archenyb,Corine Fulchironb,Regis Montvernaya,Guillaume Perrina, Denis F. Leroux*a aTechnology Research Department, Innovation Unit,bioMérieux SA, Marcy l’Etoile, France; bR&D Microbiology,bioMérieux SA, La Balme les Grottes,FranceBioMérieux致力于研究自動(dòng)化微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室,以降低成本 (更少的人力和耗材), 提升性能 (提升靈敏度,機(jī)器算法),并通過優(yōu)化臨床實(shí)驗(yàn)室工作流,獲得可追溯性。在這項(xiàng)研究中, 我們?cè)u(píng)估了采用高光譜成像技術(shù)(HIS)代替人類視覺觀測(cè)微生物培養(yǎng)解讀的可能性。在顯色培養(yǎng)基中培養(yǎng)24小時(shí)后,通過分析,微生物菌落從19種被過濾細(xì)分為6種顯色種類(chromID® CPS Elite, bioMérieux, France)。高光譜成像技術(shù)在400-900納米光譜區(qū)域采用線陣掃描分析,利用線性混合像元分解算法,并使用專門的漫反射光譜(DRS)作為輸入數(shù)據(jù),我們采用完全自動(dòng)化的方法,獲得組內(nèi)100%的分類精度,并沒有采用形態(tài)信息。為了簡(jiǎn)化儀器,我...
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2020
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07
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09
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